發(fā)布日期:2017-10-17
近日,《自然》和《自然—遺傳學(xué)》發(fā)表的系列論文全面介紹了基因表達在人體不同組織和個體中的差異,這些發(fā)現(xiàn)為認識健康組織中基因變異和基因表達的關(guān)聯(lián)帶來了新啟示,有望揭示有關(guān)疾病分子起源的新線索。
人類基因組通過編碼指令調(diào)控基因表達?;虮磉_因細胞類型的不同而存在差異,并產(chǎn)生具有不同功能的多樣化組織;它們在不同個體中也存在差異。驅(qū)動這些差異產(chǎn)生的序列一般處于基因組的非編碼區(qū)域,它們決定基因表達的方式和時間。但是,目前有關(guān)基因調(diào)控和基因表達在不同人體組織和個體中的差異的研究仍然較為有限。
基因型—組織表達(GTEx)研究聯(lián)盟收集并研究了來自449名生前健康的捐獻者的7000多份尸檢樣本,涵蓋44個組織,包括31個實體器官組織、10個腦分區(qū)、全血、兩個來自捐獻者血液和皮膚的細胞系。研究人員利用這些樣本研究基因表達在不同組織和個體中有何差異。他們在《自然》論文中報告稱,他們采用了表達定量性狀遺傳位點(eQTL)作圖法,顯示大多數(shù)的人類基因受局部變異影響,變異序列靠近受影響的基因。他們還鑒定出有93個基因的表達受到距離較遠的變異的影響,包括位于不同染色體上的變異。
在新出版的《自然》中,還有一篇論文考察了罕見變異在基因表達中的作用,兩篇論文采用GTEx數(shù)據(jù)探討了與基因表達相關(guān)聯(lián)的基因變異如何調(diào)節(jié)RNA編輯和X染色體失活現(xiàn)象。在《自然—遺傳學(xué)》發(fā)表的一篇相關(guān)評論文章中,研究者介紹了GTEx擴展項目。它是GTEx項目的擴展,為研究遺傳差異如何通過分子表型一步步影響人類健康提供了資源。
綜合而言,這些發(fā)現(xiàn)凸顯了源自不同個體和組織的數(shù)據(jù)對于鑒定人類疾病相關(guān)變異背后的基因和機制的價值。“各方齊心協(xié)力,克服了大規(guī)模獲取人體死后樣本所存在的倫理、法律和技術(shù)挑戰(zhàn),”美國伊利諾伊州芝加哥大學(xué)的Yoav Gilad等人在文章中寫道,“GTEx研究聯(lián)盟生成的廣泛數(shù)據(jù)使我們向破譯基因組調(diào)控密碼又前進了一步。基因變異對于基因表達的影響正逐漸變得明晰起來。”
來源:中國科學(xué)報



