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研究人員鑒定出結腸癌中的基因突變網(wǎng)絡

   日期:2017-12-09     瀏覽:115    
核心提示:發(fā)布日期:2017-12-08 韓國高等科學技術學院(KAIST,Korea Advanced

發(fā)布日期:2017-12-08

韓國高等科學技術學院(KAIST,Korea Advanced Institute of Science and Technology)的研究小組鑒定出結腸腫瘤發(fā)生的基因網(wǎng)絡原則。這些原則未來將被用于尋找有效抗癌藥物的分子靶點。而且,該研究因為使用了系統(tǒng)生物學的方法得到人們的關注,系統(tǒng)生物學恰恰是生物技術(BT)和信息技術(IT)的綜合研究領域。

KAIST生物和腦部工程系Kwang Hyun Cho教授領導的研究小組成功地開展了這項研究;研究人員包括Dongkwan Shin博士以及學生研究員Jonghoon Lee和Jeong Ryeol Gong。11月2日,《自然通訊》(Nature Communications)雜志在線發(fā)表了此項研究結果。

人類癌癥是由基因突變引起的?;蛲蛔兊念l率因癌癥的類型各異而不同------例如,白血病和兒童癌癥中只有大約10個突變;但是在成人實體癌中平均有50個突變;由外部因素引發(fā)的癌癥甚至包含數(shù)百個突變(如肺癌)。

世界各地的癌癥研究人員正在努力識別病人體內(nèi)經(jīng)常發(fā)現(xiàn)的基因突變,進而發(fā)現(xiàn)重要的癌癥誘導基因(稱為“驅動基因”),用來開發(fā)抗癌藥物的靶點。然而,基因突變不僅影響其自身功能,而且通過相互作用影響其他基因。因此,現(xiàn)在的治療方法局限于靶向少數(shù)癌癥誘導基因,而沒有進一步了解基因網(wǎng)絡,所以目前的藥物只在少數(shù)患者中有效,并且常常導致耐藥性。

Cho教授的研究小組利用癌癥患者的大規(guī)?;蚪M數(shù)據(jù),建立了有關基因相互作用網(wǎng)絡中多個基因突變協(xié)同效應的數(shù)學模型。該模型構建的基礎是國際癌癥基因組聯(lián)盟提出的癌癥基因組圖譜(TCGA)。研究小組成功地通過臨床特征,量化了基因網(wǎng)絡突變對結腸癌患者群體的影響。

而且,研究人員利用大規(guī)模計算機模擬分析,鑒定了腫瘤發(fā)生過程中的關鍵轉換現(xiàn)象,這是第一個被識別的隱藏的基因網(wǎng)絡原理。臨界相變是物質通過相變突然變化的現(xiàn)象。過去,人們無法確定是否存在轉換現(xiàn)象,因為在腫瘤發(fā)生過程中很難追蹤基因突變的序列。 該研究小組采用了基于系統(tǒng)生物學的研究方法發(fā)現(xiàn),如果已知的“驅動基因”突變順序地緊隨其后,那么結腸癌腫瘤的形成就會顯示出一個關鍵的轉換現(xiàn)象。研究小組利用自主開發(fā)的數(shù)學模型,可能研發(fā)出一種新的抗癌靶向藥物,能夠最有效地抑制,在癌癥患者當中發(fā)現(xiàn)的許多基因突變的影響。特別是,研究人員不僅可以評估“驅動基因”,而且可以評估受基因突變的影響的其他“乘客基因”,以便找到最有效的藥物靶標。

Cho教授說:“人們對腫瘤發(fā)生過程中許多基因突變的作用知之甚少。”他繼續(xù)說,“在這項研究中,系統(tǒng)生物學方法首次發(fā)現(xiàn)了基因網(wǎng)絡的原理,從一個新的角度提出了抗癌藥物靶點識別的可能性。” 這項研究是由韓國科學信息通信技術部(Ministry of Science and ICT)和韓國國家研究基金會(NRF)資助的。

來源:韓國科學技術院

 
 
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