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中國科學(xué)家研發(fā)新病原體抗原性計算平臺

   日期:2018-05-10     瀏覽:100    
核心提示:發(fā)布日期:2018-05-09   新發(fā)傳染病嚴重威脅人類健康,危害國家經(jīng)濟建設(shè)與社會穩(wěn)定,如何

發(fā)布日期:2018-05-09

  新發(fā)傳染病嚴重威脅人類健康,危害國家經(jīng)濟建設(shè)與社會穩(wěn)定,如何有效預(yù)防新發(fā)傳染病在易感人群中傳播是人類面臨的重大挑戰(zhàn)。復(fù)旦大學(xué)披露,上海市公共衛(wèi)生臨床中心、復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院徐建青教授課題組和同濟大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院曹志偉教授課題組合作研發(fā)了一個新的病原體抗原性計算平臺。

  據(jù)悉,利用疫苗預(yù)防傳染病是最有效、最經(jīng)濟的手段,但傳統(tǒng)疫苗研發(fā)手段投入大、耗時長,給及時阻止新發(fā)傳染病播散帶來嚴重挑戰(zhàn)。課題組方面表示,如何利用現(xiàn)有的疫苗或設(shè)計廣譜抗病毒疫苗來預(yù)防新發(fā)病毒性傳染病是最值得探索的手段,其核心技術(shù)問題與挑戰(zhàn)是如何快速的篩選或者設(shè)計能夠針對同類病毒甚至不同病毒具有交叉保護作用的疫苗免疫原。

  研究人員設(shè)計了一個空間免疫表位比對工具CE-BLAST,以高效計算不同病原體之間的抗原性距離。與以往的計算方法相比,CE-BLAST最大的優(yōu)勢在于可以不需要借助于實驗數(shù)據(jù)作為訓(xùn)練來構(gòu)建模型,這對于一些還缺少實驗數(shù)據(jù)的新病原體而言以及新爆發(fā)的傳染性疾病(例如寨卡病毒)而言尤為關(guān)鍵。

  研究成果新近以《CE-BLAST:一種計算新發(fā)傳染病病原體抗原性相似度的新型平臺》為題在線發(fā)表于《自然·通訊》。

  據(jù)介紹,研究人員在病毒亞型內(nèi)不同毒株間(甲型流感病毒H3N2亞型),病毒不同亞型之間(登革病毒不同血清型),跨病毒(黃病毒科登革病毒及寨卡病毒)這三個層面上依次驗證了方法的有效性。

  研究人員還利用CE-BLAST構(gòu)建出了一株廣譜抗甲型流感病毒H3N2亞型不同毒株的疫苗,并在動物實驗上得到很好的保護譜范圍。研究表明,該方法有望設(shè)計出針對新發(fā)病毒具有交叉保護作用的新型疫苗。

  據(jù)介紹,有趣的是,本方法計算出寨卡與登革熱病毒存在高度相似的抗體表位,現(xiàn)有的登革熱疫苗有潛在交叉預(yù)防寨卡病毒的作用,而這一預(yù)測已被領(lǐng)域內(nèi)其他實驗室的動物研究所證實。

來源:中國新聞網(wǎng)

 
 
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